Data, analyse et visualisation [WIKI Les Portes Logiques]

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====== Data, analyse et visualisation ======

(page créée le 29 avril 2022)
Outils code, logiciel, web pour manipuler, traiter, analyser, visualiser des données

===== Formats =====

==== Texte / Flat files ====

**CSV** (Comma Separated Value) : 
  * https://fr.wikipedia.org/wiki/Comma-separated_values
**JSON** (JavaScript Object Notation) :
  * https://www.json.org/json-en.html
  * https://fr.wikipedia.org/wiki/JavaScript_Object_Notation

==== Bases de données ====

(...)

===== Notebook =====

==== Observable ====

Observable est un carnet de notes augmenté, qui permet de créer des documents interactifs pour représenter des analyses de données interactives. Sur un même document web, on peut assembler : du code javascript, des images, du texte en markdown, du HTML, etc. Mais aussi de téléversser des fichiers de données de différents formats (CSV, XLSX), de se relier à des fichiers du cloud, des API ou des bases de données.\\

Plusieurs bibliothèques de code javascript sont accessibles directement : [[https://observablehq.com/@d3/learn-d3-by-example|d3]], [[https://observablehq.com/@observablehq/plot|plot]], survey, [[https://observablehq.com/@motiondesign_01/setting-up-p5js|p5.js]]

C'est aussi une communauté et un document public peut-être forké pour en créer un nouveau que l'on peut modifier, plusieurs templates sont aussi fournis pour démarrer de nouveaux documents.

Les exemples sont nombreux : 
  * https://observablehq.com/explore
  * https://observablehq.com/@d3/gallery

Doc : https://observablehq.com/@observablehq/documentation

Plot :
  * https://observablehq.com/@observablehq/plot-cheatsheets
  * https://github.com/observablehq/plot/blob/main/README.md

Survey :
  * https://observablehq.com/@observablehq/survey-report-builder
  * https://observablehq.com/@observablehq/survey-data
  * https://observablehq.com/@observablehq/survey-cross-tabulation-analysis

p5.js :
  * https://observablehq.com/@tmcw/p5
  * https://observablehq.com/@irenedelatorre/canvas-p5-js-and-circle-packing-collision-and-cluster-force exemple complet avec variables externes

Utiliser SQL (on peut transformer un doc JSON ou CSV en base de données et l'interroger grâce à DuckDB)
  * https://observablehq.com/@cmudig/duckdb-client

Diagrammes de Venn
  * https://observablehq.com/@dunderdan/simple-venn-diagram-generator (2 ensembles)
  * https://observablehq.com/@chenlianmt/simple-venn-diagram-generator (3 ensembles)

Upset Plots, représentation d'intersections d'ensemble multiples
  * https://observablehq.com/@spren9er/upset-plots-with-observable-plot

Wordcloud
  * https://observablehq.com/@d3/word-cloud

Une sorte de Best of 2021 : https://observablehq.com/@tomlarkworthy/notebooks2021

===== Autres services en ligne =====

**rawgraphs.io** application en ligne avec de nombreux types de visualisation : https://app.rawgraphs.io/

**upset.js** création d'//upset plots//, intersections d'ensembles multiples : https://upset.js.org/app/

===== Ligne de commande =====

**csvkit** \\
Ensemble d'outils en ligne de commande pour manipuler des fichiers CSV 
  * https://csvkit.readthedocs.io/en/latest/
  * https://github.com/wireservice/csvkit

**qsv** : https://github.com/jqnatividad/qsv

**xsv** : https://github.com/BurntSushi/xsv

===== Par type de représentation =====

**Représentations de graphes**
  * graphviz : https://graphviz.org/docs/layouts/
  * viz.js, packages javascript pour graphviz : https://github.com/mdaines/viz-js
  * éditeur en ligne https://viz-js.com/

**Diagramme de Venn** \\
Utile pour représenter le croisement de 2 ou 3 ensembles
  * Voir ci-dessus pour ObservableHQ
  * 

**Upset Plots** \
Utile pour représenter les croisements d'ensembles multiples 
  * https://github.com/upsetjs/upsetjs, création en ligne interactive : https://upset.js.org/app/
  * en ligne : https://upset.app/ (formatage des données : https://upset.app/advanced/#tabular)

Par exemple pour utiliser https://upset.js.org/app/ on formatera les données comme ceci :
<code>
id;reponse1;reponse2;reponse3
1;0;0;1
2;1;0;1
3;0;1;0

id      reponse1      reponse2       reponse3
1          0             0              1
2          1             0              1
3          0             1              0
</code>

**Nuage de mots / wordcloud** \\
Utile pour représenter des réponses libres à une question

===== Code =====

==== Python ====

**agate** \\
Bibliothèque python pour l'analyse
  * https://agate.readthedocs.io/en/latest/about.html
  * https://github.com/wireservice/agate

==== Javascript ====

**d3js**
  * https://d3js.org/

**vega**
  * https://vega.github.io/vega/

**vega-lite**
  * https://vega.github.io/vega-lite/

===== Logiciels =====

(...)